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里。忍者的进攻技巧除了纯粹正面进攻所需的剑术、箭术、马术、柔术及投镖之外，隐遁之术也是非常重要的组成部分。隐遁之术也就是逃脱之术，在行动出现始料未及的情况下，忍者便依靠各种独门秘术一纵即逝。
在行动中，除了刀剑外，忍者最常使用的武器是各类飞镖以及其他特制器物，如手里剑、撒菱、手甲钩、水蜘蛛、忍刀等。
手里剑即铁蒺藜，是一种投掷武器，九米之内可以使人立刻毙命。其种类多样，有八角形、六角形、十字形等。忍者在使用手里剑时，事先会涂上毒汁，从而成为杀伤力极强的武器。撒菱，是忍者使用隐遁之术时撒在身后的一种菱形武器，使敌人难以近身，为自己顺利脱身赢得时间。手甲钩是忍者近距离搏斗时除了刀剑外使用频率最高的一种武器，其外形多变，可轻易致人于死地。水蜘蛛是一种水面行走工具，能让忍者在水面上快速通过，从而减少暴露行踪的几率。忍刀比武士刀短得多，质量也较差，它的用处不在实战，而在于其多用途的功能。将忍刀往地上一插，刀的护圈便可当作垫脚之物；把刀的护圈往高处一挂，双手可安全地握住刀身攀缘上升。刀鞘可以在水中当作呼吸和窃听工具。
对于忍者来说，除了掌握高超的忍术外，对自我的严格要求也是其性情修养的重要一面。所谓的严格要求也包括饮食方面的控制。由于忍者行动中必须经常性地待在狭窄的空间里，因此，忍者必须保持瘦小的体格，发胖对于忍者而言，是与被杀同样可怕的事情。所以，忍者在饮食方面极为慎重，有其特殊的食谱，被称为“忍者食”。“忍者食”以稻米为主，配以清淡的蔬菜，而能快速增加体重、增强体味的食物则一律排除在外。
忍者还有“携带食”一说，“携带食”就是行动中为能随时补充能量而携带的食物，因为忍者一旦在某处执行任务，就不能随意离开特定位置，以免暴露位置，这就需要随时能充饥的食物。这些“携带食”主要有饭团、芋头等。
战国时代，忍者发展迅猛，流派繁多，其中以伊贺与甲贺两派最为强盛。伊贺与甲贺虽都地处群山地带，但是立场各异，互相敌视。伊贺忍者起先并未依从任何一个战国大名，但因其势力发展过快，遭到了当时欲统一日本的织田信长的忌惮。1581年9月，织田信长发重兵对伊贺展开了大规模清剿，伊贺派创始人百地三太夫战死沙场，伊贺派势力遭到重创，后依附于德川家康，在其图霸大业中立下汗马功劳，成为德川氏的御用忍者。
相对于伊贺派最初的“自由之身”，甲贺派则非常自觉地寻找着自己的靠山，先是六角氏，后为细川氏，再后依从于织田信长。依托其势力，甲贺派得以迅猛发展，本能寺之变后，甲贺派发生分裂，迅速衰落，至江户时代中期，几乎销声匿迹。
伊贺与甲贺虽然门派不同，各有从属，但是这两大忍者流派为忍者基本规范的奠定都作出了巨大的贡献。1676年，忍者藤林保武参照《六韬》和《孙子兵法》的内容，结合伊贺与甲贺的思想精髓，写成了忍者书《万川集海》。
《万川集海》共有十卷，分别从忍者的历史、忍者的人格修养、忍者的组织形态、忍者的智慧、忍者的计谋、忍者的武器等诸多方面对其理论基础与技术能力加以系统阐释，可以说是了解忍者世界的百科全书。